短波定義為900-1700 nm，雖然短波對人眼來說是不可見的，但是這個波段的光能以與可見光類似的方式和物體互相作用。因此，通過InGaAs相機的采集，短波圖像可以與可見光圖像一樣具有圖像分辨率和細節等。與可見光以及近紅外的800-900nm光相比，短波紅外在生物組織中的散射較小，因此短波紅外熒光生物成像有利于提高成像的深度和空間分辨率；此外，生物組織在短波紅外波段的自發熒光相對較小，從而可以提高成像的信噪比。